شناسایی ژن های مرتبط با تنش خشکی در بادام وحشی گونه prunus scoparia با استفاده از روش cdna-aflp

بادام وحشی گونه prunus scoparia متعلق به خانواده rosaceae، زیرخانواده pronoideae و جنس prunus درختی خوش منظر، سبز رنگ، خزان کننده، دارای شاخه های فراوان، افراشته، صاف و براق و ساقه های ایستا است. ارتفاع این درخت به 6 متر می رسد و مقاوم به شرایط نامساعد محیطی خصوصاً کم آبی می باشد. دامنه انتشار این گونه وسیع است و در نواحی استپی و ارتفاعات نیم خشک کشور دیده می شود. نام محلی آن در نقاط مختلف بارشین، بادامک، بادامچه و بادامشک می باشد. این گیاه در مناطق کوهستانی ایران در استان های فارس، خوزستان، چهارمحال و بختیاری، یزد، کردستان، سیستان و بلوچستان، تهران، کرمانشاه، خراسان، کرمان، اصفهان، مرکزی و لرستان دیده شده و در انواع مختلف خاک ها رشد می کند. تنش خشکی یکی از عوامل محدود کننده رشد و تولید محصول در گیاهان است و به همین دلیل شناخت ژن های مسئول تنش خشکی در گیاهان ضروری است. در این مطالعه به منظور شناسایی ژن های مسئول تنش خشکی در بادام وحشی گونه p. scoparia از روش cdna-aflp استفاده شد. از بین قطعات حاصل از تکثیر cdna-aflp روی ژل اکریل آمید تعداد 20 قطعه از قطعاتی که بین شرایط کنترل و تنش بروز متفاوتی را نشان دادند، از ژل جدا و توالی یابی گردیدند. آنالیزهای انجام شده روی توالی ها در سایت ncbi درصد بالایی از شباهت، بین این توالی ها با ژن هایی که قبلاً در گیاهانی مثل آرابیدوپسیس، زردآلو، سپیدار، ذرت، برنج، سویا، سورگوم و چند گونه گیاهی دیگر شناسایی شده اند را نشان داد. از بین ژن های شناسایی شده تعداد 5 ژن (leucine rich repeat protein (lrr)، protein kinase mk5 ، 2-deoxyglucose-6-phosphate phosphatase، (zep یا zeaepox) zeaxanthin epoxidase و (ssvi) starch synthase vi) به عنوان ژن های کاندید برای مقاومت به خشکی انتخاب گردیدند و بررسی روی آن ها انجام شد. به منظور تأیید ارتباط بین این ژن ها با تنش خشکی از روش pcr در زمان واقعی (real-time pcr) استفاده گردید. شناسایی و تشخیص این ژن ها در آینده زمینه مناسبی را برای تولید ارقام اصلاح شده مقاوم به خشکی فراهم خواهد ساخت.